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2) Save Model to Registry

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목표

  1. 모델을 학습하고 MLflow 서버에 저장합니다.
  2. MLflow 의 모델 저장 구조를 이해합니다.

스펙 명세서

  1. 02. Model Development 파트에서 사용한 코드를 이용하여 모델을 학습합니다.
  2. 학습이 끝난 모델을 MLflow 의 built-in method 를 사용해 MLflow 서버에 저장합니다.
    • Python의 mlflow 패키지를 이용합니다.
      • pip install mlflow
    • mlflow 패키지를 이용하여 모델을 1) MLflow Setup 챕터에서 띄운 MLflow 서버에 저장합니다.
    • mlflow 패키지를 이용하여 모델을 저장하는 방법은 두 가지가 있습니다.
    • 이번 챕터에서는 sklearn 모델을 저장하기 위해 mlflow.sklean built-in method 를 사용합니다.
  3. 저장된 모델을 작동 중인 MLflow 서버에서 확인합니다.
https://github.com/mlops-for-mle/mlops-for-mle/tree/main/part3

해당 파트의 전체 코드는 mlops-for-mle/part3/ 에서 확인할 수 있습니다.

part3
├── Dockerfile
├── Makefile
├── README.md
├── docker-compose.yaml
├── load_model_from_registry.py
└── save_model_to_registry.py

Model Upload diagram [그림 3-6] MLflow Model Save Diagram

0. 패키지 설치

아래 명령어를 통해 관련 패키지를 설치합니다.

pip install boto3==1.26.8 mlflow==1.30.0 scikit-learn

1. 모델 저장하기

1.1 기존 코드 확인 & 환경 변수 설정

1.1.1 db_train.py

02. Model Development 파트의 3) Load Data from Database 챕터에서 작성한 db_train.py 코드의 # 3. save model 부분을 변경하여 모델을 업로드하는 코드를 작성합니다. 작성한 db_train.py 코드는 다음과 같습니다.
db_train.py
# db_train.py
import joblib
import pandas as pd
import psycopg2
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.svm import SVC

# 1. get data
db_connect = psycopg2.connect(
user="myuser",
password="mypassword",
host="localhost",
port=5432,
database="mydatabase",
)
df = pd.read_sql("SELECT * FROM iris_data ORDER BY id DESC LIMIT 100", db_connect)
X = df.drop(["id", "timestamp", "target"], axis="columns")
y = df["target"]
X_train, X_valid, y_train, y_valid = train_test_split(X, y, train_size=0.8, random_state=2022)

# 2. model development and train
model_pipeline = Pipeline([("scaler", StandardScaler()), ("svc", SVC())])
model_pipeline.fit(X_train, y_train)

train_pred = model_pipeline.predict(X_train)
valid_pred = model_pipeline.predict(X_valid)

train_acc = accuracy_score(y_true=y_train, y_pred=train_pred)
valid_acc = accuracy_score(y_true=y_valid, y_pred=valid_pred)

print("Train Accuracy :", train_acc)
print("Valid Accuracy :", valid_acc)

# 3. save model
joblib.dump(model_pipeline, "db_pipeline.joblib")

# 4. save data
df.to_csv("data.csv", index=False)

1.1.2 환경 변수 추가

MLflow 와 통신하기 위해서는 몇 가지 환경 변수가 설정되어야 합니다.

[그림 3-6]을 보면 유저가 학습한 모델을 MLflow 서버를 통해 Artifact Store 인 MinIO 에 저장합니다. 이 과정에서 MinIO 의 접근 권한이 필요하게 됩니다. 이 접근 권한 정보는 1) MLflow Setup 챕터의 Docker Compose 파일에서 설정한 mlflow-server , mlflow-artifact-store 의 정보와 같습니다. 접근에 사용할 아이디와 비밀번호는 사전에 정의된 시스템 환경 변수에 설정해야 MinIO 에 접근할 수 있습니다. 같은 방식으로 서비스가 띄워져있는 MLflow 서버와 S3 (MinIO) 의 URI 도 함께 설정합니다.

import os

os.environ["MLFLOW_S3_ENDPOINT_URL"] = "http://localhost:9000"
os.environ["MLFLOW_TRACKING_URI"] = "http://localhost:5001"
os.environ["AWS_ACCESS_KEY_ID"] = "minio"
os.environ["AWS_SECRET_ACCESS_KEY"] = "miniostorage"

os 라이브러리를 이용해 시스템의 환경변수를 설정합니다.

  • MLFLOW_S3_ENDPOINT_URL :
    • 모델을 저장할 스토리지의 주소입니다.
    • 1) MLflow Setup 챕터에서 띄운 MinIO API 서버 주소와 같으며 http://localhost:9000 입니다.
  • MLFLOW_TRACKING_URI :
    • 정보를 저장하기 위해 연결할 MLflow 서버의 주소입니다.
    • 1) MLflow Setup 챕터의 MLflow 서버 주소와 같으며 http://localhost:5001 입니다.
  • AWS_ACCESS_KEY_ID :
    • MinIO 에 접근하기 위한 아이디입니다.
    • 1) MLflow Setup 챕터에서 설정한 MINIO_ROOT_USERminio 를 사용합니다.
  • AWS_SECRET_ACCESS_KEY :
    • MinIO 에 접근하기 위한 비밀번호입니다.
    • 1) MLflow Setup 챕터에서 설정한 MINIO_ROOT_PASSWORDminiostorage 를 사용합니다.

1.2 모델 저장하기

MLflow 는 정보를 저장하기 위해 experimentrun 을 사용합니다.

  • experiment : MLflow 에서 정보를 관리하기 위해 나누는 일종의 directory 입니다. BERT, ResNet 과 같이 특정 이름을 통해 생성 할 수 있으며, 생성하지 않고 MLflow 에 정보를 저장하는 경우 Default 라는 이름의 experiment 에 저장됩니다.
  • run : experiment 에 저장되는 모델 실험 결과 입니다. 해당 run 에 실제 정보들이 저장되게 되며, experiment/run 의 구조로 저장됩니다.

MLflow 는 정보 저장에 관련된 스크립트를 실행 할 때 명시된 experimentrun 을 동적으로 생성합니다. 이 때, 각각의 run 은 unique 한 해쉬값인 run_id 를 부여받게 되며 이를 이용하여 저장된 후에도 해당 정보에 접근할 수 있습니다.

앞서 설명한대로 정보를 저장 할 가장 큰 카테고리인 experiment 의 이름을 지정하지 않는 경우 기본 값으로 Default 라는 이름의 experiment 에 run 이 생성됩니다. 실습에서는 new-exp 라는 이름을 가진 새로운 experiment 를 생성하고, 생성된 new-exprun 을 생성하는 방식으로 진행합니다.

02. Model Development 파트의 모델과 모델의 결과 metric 인 정확도를 저장해보겠습니다.

mlflow 클래스를 이용하여 다음과 같이 작성합니다.

  1. 모델의 이름을 설정할 수 있는 외부 변수를 설정합니다. MLflow 에서는 모델을 저장할 때 이름을 설정하여 관리하게 됩니다. 이번 챕터에서는 기본값으로 sk_model 을 사용하겠습니다.

    from argparser import ArgumentParser

    parser = ArgumentParser()
    parser.add_argument("--model-name", dest="model_name", type=str, default="sk_model")
    args = parser.parse_args()
  2. experiment 를 설정합니다. mlflow.set_experiment 함수는 experiment 가 존재하지 않는 경우 새로 생성되며, 존재하는 경우 해당 experiment 를 사용합니다.

    mlflow.set_experiment("new-exp")
  3. 추후 잘못된 정보들이 들어올 경우 에러를 발생시키기 위해, 모델에 입력값 정보들을 설정합니다.

    signature = mlflow.models.signature.infer_signature(model_input=X_train, model_output=train_pred)
    input_sample = X_train.iloc[:10]
    print(signature)
    # inputs:
    # ['sepal_length': double, 'sepal_width': double, 'petal_length': double, 'petal_width': double]
    # outputs:
    # [Tensor('int64', (-1,))]

    print(input_sample)
    # sepal_length sepal_width petal_length petal_width
    # 86 5.7 2.9 4.2 1.3
    # 73 4.5 2.3 1.3 0.3
    # 4 6.9 3.1 4.9 1.5
    # 31 4.9 3.1 1.5 0.2
    # 10 4.6 3.2 1.4 0.2
    # 1 5.4 3.9 1.3 0.4
    # 51 5.6 2.8 4.9 2.0
    # 63 4.4 3.0 1.3 0.2
    # 7 7.4 2.8 6.1 1.9
    # 64 5.5 2.5 4.0 1.3
  4. run 을 생성하고 정보를 저장합니다.

    with mlflow.start_run():
    mlflow.log_metrics({"train_acc": train_acc, "valid_acc": valid_acc})
    mlflow.sklearn.log_model(
    sk_model=model_pipeline,
    artifact_path=args.model_name,
    signature=signature,
    input_example=input_sample,
    )
    • mlflow.log_metrics :
      • 모델의 결과 metrics 를 Python 의 dictionary 형태로 입력해 생성된 run 에 저장합니다.
    • mlflow.sklearn.log_model :
      • sklearn 의 모델은 mlflow.sklearn 를 사용하여 간편하게 업로드가 가능합니다.
      • 학습된 모델 결과물이 sklearn 객체일 경우 [MLFlow Storage Format]의 구조로 run 에 저장합니다.
  5. 모델은 다음과 같은 구조로 저장됩니다.

    # Directory written by mlflow.sklearn.save_model(model, "sk_model")

    sk_model/
    ├── MLmodel
    ├── model.pkl
    ├── conda.yaml
    ├── python_env.yaml
    └── requirements.txt

2. 전체 코드 완성 및 모델 확인

추가 작성한 코드를 전체 코드에 적용하여 완성합니다.

2.1 save_model_to_registry.py

save_model_to_registry.py
# save_model_to_registry.py
import os
from argparse import ArgumentParser

import mlflow
import pandas as pd
import psycopg2
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.svm import SVC

# 0. set mlflow environments
os.environ["MLFLOW_S3_ENDPOINT_URL"] = "http://localhost:9000"
os.environ["MLFLOW_TRACKING_URI"] = "http://localhost:5001"
os.environ["AWS_ACCESS_KEY_ID"] = "minio"
os.environ["AWS_SECRET_ACCESS_KEY"] = "miniostorage"

# 1. get data
db_connect = psycopg2.connect(
user="myuser",
password="mypassword",
host="localhost",
port=5432,
database="mydatabase",
)
df = pd.read_sql("SELECT * FROM iris_data ORDER BY id DESC LIMIT 100", db_connect)

X = df.drop(["id", "timestamp", "target"], axis="columns")
y = df["target"]
X_train, X_valid, y_train, y_valid = train_test_split(X, y, train_size=0.8, random_state=2022)

# 2. model development and train
model_pipeline = Pipeline([("scaler", StandardScaler()), ("svc", SVC())])
model_pipeline.fit(X_train, y_train)

train_pred = model_pipeline.predict(X_train)
valid_pred = model_pipeline.predict(X_valid)

train_acc = accuracy_score(y_true=y_train, y_pred=train_pred)
valid_acc = accuracy_score(y_true=y_valid, y_pred=valid_pred)

print("Train Accuracy :", train_acc)
print("Valid Accuracy :", valid_acc)

# 3. save model
parser = ArgumentParser()
parser.add_argument("--model-name", dest="model_name", type=str, default="sk_model")
args = parser.parse_args()

mlflow.set_experiment("new-exp")

signature = mlflow.models.signature.infer_signature(model_input=X_train, model_output=train_pred)
input_sample = X_train.iloc[:10]

with mlflow.start_run():
mlflow.log_metrics({"train_acc": train_acc, "valid_acc": valid_acc})
mlflow.sklearn.log_model(
sk_model=model_pipeline,
artifact_path=args.model_name,
signature=signature,
input_example=input_sample,
)

# 4. save data
df.to_csv("data.csv", index=False)

2.2 실행

완성된 코드를 실행합니다.

python save_model_to_registry.py --model-name "sk_model"

2.3 MLflow 에서 결과 확인하기

코드 실행의 결과를 localhost:5001 (MLflow 서버) 에서 확인합니다.

MLflow ui-1 [그림 3-7] 모델 저장 결과

MLflow ui-2 [그림 3-8] 모델 저장 결과 상세